Protein–RNA interactions for Protein: P02774

GC, Vitamin D-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCP02774 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GCP02774 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
GCP02774 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GCP02774 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GCP02774 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GCP02774 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GCP02774 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
GCP02774 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34■■■■□ 3.03
GCP02774 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GCP02774 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GCP02774 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GCP02774 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
GCP02774 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GCP02774 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GCP02774 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GCP02774 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GCP02774 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GCP02774 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GCP02774 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
GCP02774 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GCP02774 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
GCP02774 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GCP02774 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GCP02774 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GCP02774 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GCP02774 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GCP02774 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GCP02774 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GCP02774 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GCP02774 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
GCP02774 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GCP02774 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GCP02774 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GCP02774 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
GCP02774 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GCP02774 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GCP02774 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GCP02774 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GCP02774 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
GCP02774 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GCP02774 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GCP02774 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GCP02774 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GCP02774 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GCP02774 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GCP02774 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GCP02774 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GCP02774 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GCP02774 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GCP02774 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GCP02774 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GCP02774 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GCP02774 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GCP02774 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GCP02774 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GCP02774 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GCP02774 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GCP02774 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
GCP02774 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GCP02774 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GCP02774 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GCP02774 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GCP02774 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GCP02774 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GCP02774 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GCP02774 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GCP02774 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
GCP02774 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
GCP02774 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GCP02774 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
GCP02774 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
GCP02774 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
GCP02774 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GCP02774 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.81■■■■□ 3
GCP02774 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GCP02774 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
GCP02774 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
GCP02774 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
GCP02774 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GCP02774 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GCP02774 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.79■■■■□ 3
GCP02774 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GCP02774 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GCP02774 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GCP02774 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GCP02774 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GCP02774 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GCP02774 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GCP02774 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GCP02774 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
GCP02774 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GCP02774 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GCP02774 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GCP02774 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GCP02774 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
GCP02774 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
GCP02774 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GCP02774 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GCP02774 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GCP02774 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms