Protein–RNA interactions for Protein: P02675

FGB, Fibrinogen beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGBP02675 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGBP02675 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGBP02675 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FGBP02675 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGBP02675 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FGBP02675 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGBP02675 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGBP02675 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGBP02675 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FGBP02675 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGBP02675 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGBP02675 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGBP02675 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGBP02675 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGBP02675 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FGBP02675 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGBP02675 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FGBP02675 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGBP02675 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGBP02675 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGBP02675 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGBP02675 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGBP02675 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGBP02675 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGBP02675 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGBP02675 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGBP02675 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGBP02675 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FGBP02675 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGBP02675 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGBP02675 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGBP02675 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGBP02675 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGBP02675 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGBP02675 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGBP02675 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FGBP02675 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGBP02675 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGBP02675 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGBP02675 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGBP02675 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGBP02675 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGBP02675 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGBP02675 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGBP02675 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FGBP02675 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FGBP02675 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGBP02675 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGBP02675 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGBP02675 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGBP02675 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGBP02675 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGBP02675 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGBP02675 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGBP02675 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FGBP02675 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
FGBP02675 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGBP02675 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGBP02675 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGBP02675 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGBP02675 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGBP02675 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGBP02675 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGBP02675 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGBP02675 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FGBP02675 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGBP02675 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FGBP02675 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGBP02675 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGBP02675 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGBP02675 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGBP02675 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FGBP02675 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGBP02675 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGBP02675 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGBP02675 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGBP02675 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FGBP02675 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGBP02675 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGBP02675 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGBP02675 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FGBP02675 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGBP02675 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FGBP02675 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGBP02675 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGBP02675 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGBP02675 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGBP02675 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGBP02675 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGBP02675 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGBP02675 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FGBP02675 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGBP02675 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGBP02675 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGBP02675 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGBP02675 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGBP02675 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGBP02675 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGBP02675 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGBP02675 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms