Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTA1P02549 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTA1P02549 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms