Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOP3BO95985 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP3BO95985 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOP3BO95985 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP3BO95985 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP3BO95985 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms