Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF6O94906 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF6O94906 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF6O94906 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF6O94906 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF6O94906 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF6O94906 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF6O94906 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF6O94906 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF6O94906 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF6O94906 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF6O94906 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF6O94906 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF6O94906 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF6O94906 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF6O94906 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF6O94906 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF6O94906 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF6O94906 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF6O94906 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRPF6O94906 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF6O94906 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF6O94906 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF6O94906 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF6O94906 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF6O94906 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF6O94906 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF6O94906 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF6O94906 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF6O94906 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRPF6O94906 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF6O94906 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF6O94906 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF6O94906 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF6O94906 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF6O94906 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF6O94906 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms