Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ9O75208 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ9O75208 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ9O75208 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ9O75208 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ9O75208 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ9O75208 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ9O75208 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ9O75208 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ9O75208 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ9O75208 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ9O75208 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ9O75208 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ9O75208 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ9O75208 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ9O75208 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ9O75208 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ9O75208 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ9O75208 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ9O75208 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ9O75208 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ9O75208 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ9O75208 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ9O75208 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ9O75208 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ9O75208 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COQ9O75208 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COQ9O75208 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COQ9O75208 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COQ9O75208 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COQ9O75208 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COQ9O75208 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COQ9O75208 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COQ9O75208 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COQ9O75208 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COQ9O75208 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COQ9O75208 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COQ9O75208 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
COQ9O75208 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COQ9O75208 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COQ9O75208 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COQ9O75208 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COQ9O75208 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COQ9O75208 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COQ9O75208 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COQ9O75208 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COQ9O75208 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COQ9O75208 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COQ9O75208 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COQ9O75208 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COQ9O75208 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COQ9O75208 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COQ9O75208 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COQ9O75208 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COQ9O75208 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COQ9O75208 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COQ9O75208 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COQ9O75208 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COQ9O75208 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COQ9O75208 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COQ9O75208 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COQ9O75208 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COQ9O75208 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COQ9O75208 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COQ9O75208 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COQ9O75208 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COQ9O75208 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COQ9O75208 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COQ9O75208 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COQ9O75208 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COQ9O75208 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COQ9O75208 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ9O75208 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ9O75208 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ9O75208 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ9O75208 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ9O75208 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ9O75208 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ9O75208 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ9O75208 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ9O75208 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ9O75208 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ9O75208 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ9O75208 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ9O75208 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ9O75208 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ9O75208 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ9O75208 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ9O75208 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ9O75208 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ9O75208 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ9O75208 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ9O75208 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ9O75208 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ9O75208 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ9O75208 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ9O75208 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ9O75208 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COQ9O75208 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COQ9O75208 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms