Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
DEPDC5O75140 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
DEPDC5O75140 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DEPDC5O75140 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DEPDC5O75140 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DEPDC5O75140 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
DEPDC5O75140 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DEPDC5O75140 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
DEPDC5O75140 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
DEPDC5O75140 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
DEPDC5O75140 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
DEPDC5O75140 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms