Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSPAN1O60635 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSPAN1O60635 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSPAN1O60635 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN1O60635 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms