Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NEMFO60524 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEMFO60524 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NEMFO60524 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NEMFO60524 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEMFO60524 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEMFO60524 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEMFO60524 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEMFO60524 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEMFO60524 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEMFO60524 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEMFO60524 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEMFO60524 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEMFO60524 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEMFO60524 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEMFO60524 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEMFO60524 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NEMFO60524 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEMFO60524 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEMFO60524 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEMFO60524 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEMFO60524 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEMFO60524 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEMFO60524 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEMFO60524 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEMFO60524 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEMFO60524 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NEMFO60524 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEMFO60524 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEMFO60524 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEMFO60524 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEMFO60524 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEMFO60524 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEMFO60524 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEMFO60524 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEMFO60524 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEMFO60524 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEMFO60524 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEMFO60524 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEMFO60524 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEMFO60524 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEMFO60524 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEMFO60524 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEMFO60524 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEMFO60524 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NEMFO60524 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEMFO60524 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEMFO60524 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEMFO60524 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEMFO60524 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEMFO60524 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEMFO60524 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEMFO60524 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEMFO60524 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEMFO60524 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEMFO60524 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEMFO60524 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEMFO60524 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEMFO60524 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEMFO60524 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEMFO60524 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEMFO60524 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEMFO60524 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEMFO60524 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEMFO60524 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEMFO60524 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEMFO60524 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEMFO60524 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEMFO60524 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEMFO60524 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NEMFO60524 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEMFO60524 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NEMFO60524 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEMFO60524 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEMFO60524 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEMFO60524 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEMFO60524 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEMFO60524 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEMFO60524 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEMFO60524 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEMFO60524 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NEMFO60524 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEMFO60524 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEMFO60524 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEMFO60524 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEMFO60524 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEMFO60524 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEMFO60524 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEMFO60524 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEMFO60524 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEMFO60524 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEMFO60524 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEMFO60524 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEMFO60524 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEMFO60524 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEMFO60524 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEMFO60524 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEMFO60524 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEMFO60524 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEMFO60524 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms