Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX3O60493 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX3O60493 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX3O60493 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX3O60493 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX3O60493 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX3O60493 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX3O60493 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX3O60493 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX3O60493 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX3O60493 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX3O60493 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX3O60493 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX3O60493 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX3O60493 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX3O60493 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX3O60493 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX3O60493 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX3O60493 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX3O60493 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX3O60493 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX3O60493 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX3O60493 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX3O60493 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX3O60493 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX3O60493 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX3O60493 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX3O60493 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX3O60493 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX3O60493 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX3O60493 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX3O60493 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX3O60493 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX3O60493 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX3O60493 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX3O60493 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX3O60493 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX3O60493 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX3O60493 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX3O60493 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX3O60493 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX3O60493 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX3O60493 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX3O60493 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX3O60493 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX3O60493 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX3O60493 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX3O60493 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX3O60493 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX3O60493 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX3O60493 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX3O60493 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX3O60493 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX3O60493 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX3O60493 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX3O60493 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX3O60493 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX3O60493 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX3O60493 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX3O60493 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX3O60493 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX3O60493 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX3O60493 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX3O60493 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX3O60493 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX3O60493 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX3O60493 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX3O60493 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX3O60493 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX3O60493 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX3O60493 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX3O60493 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX3O60493 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX3O60493 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX3O60493 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX3O60493 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX3O60493 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX3O60493 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX3O60493 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX3O60493 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX3O60493 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX3O60493 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX3O60493 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX3O60493 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX3O60493 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX3O60493 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX3O60493 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX3O60493 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX3O60493 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX3O60493 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX3O60493 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX3O60493 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX3O60493 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX3O60493 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX3O60493 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX3O60493 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX3O60493 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX3O60493 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX3O60493 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX3O60493 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms