Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC40.27■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
KIAA0556O60303 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC40.24■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.2■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
KIAA0556O60303 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
KIAA0556O60303 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
KIAA0556O60303 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
KIAA0556O60303 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
KIAA0556O60303 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
KIAA0556O60303 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
KIAA0556O60303 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
KIAA0556O60303 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
KIAA0556O60303 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
KIAA0556O60303 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
KIAA0556O60303 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
KIAA0556O60303 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC40.07■■■■■ 4.01
KIAA0556O60303 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
KIAA0556O60303 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
KIAA0556O60303 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC40.06■■■■■ 4
KIAA0556O60303 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
KIAA0556O60303 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC40.05■■■■■ 4
KIAA0556O60303 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.05■■■■■ 4
KIAA0556O60303 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
KIAA0556O60303 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
KIAA0556O60303 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
KIAA0556O60303 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
KIAA0556O60303 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
KIAA0556O60303 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
KIAA0556O60303 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
KIAA0556O60303 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
KIAA0556O60303 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
KIAA0556O60303 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
KIAA0556O60303 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC40.02■■■■■ 4
KIAA0556O60303 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
KIAA0556O60303 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
KIAA0556O60303 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
KIAA0556O60303 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms