Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFRD1O00458 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFRD1O00458 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IFRD1O00458 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms