Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C0S8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C0S8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C0S8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C0S8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C0S8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C0S8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C0S8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C0S8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C0S8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C0S8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C0S8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C0S8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C0S8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C0S8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C0S8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C0S8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C0S8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C0S8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C0S8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C0S8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C0S8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C0S8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C0S8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C0S8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C0S8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C0S8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C0S8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C0S8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C0S8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C0S8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C0S8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C0S8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C0S8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C0S8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C0S8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C0S8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C0S8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C0S8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C0S8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C0S8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C0S8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C0S8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
H7C0S8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C0S8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C0S8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C0S8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C0S8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0S8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0S8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0S8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0S8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0S8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0S8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C0S8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C0S8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C0S8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C0S8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C0S8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C0S8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0S8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0S8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0S8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0S8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0S8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0S8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0S8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0S8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C0S8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C0S8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C0S8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C0S8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C0S8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C0S8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C0S8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C0S8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C0S8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C0S8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C0S8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C0S8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C0S8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C0S8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C0S8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0S8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0S8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0S8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0S8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0S8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0S8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0S8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0S8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H7C0S8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H7C0S8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H7C0S8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H7C0S8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H7C0S8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H7C0S8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H7C0S8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H7C0S8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H7C0S8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms