Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BNX3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BNX3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BNX3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BNX3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BNX3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BNX3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BNX3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BNX3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BNX3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BNX3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BNX3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BNX3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BNX3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BNX3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BNX3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BNX3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BNX3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BNX3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BNX3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BNX3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BNX3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BNX3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BNX3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BNX3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BNX3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BNX3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BNX3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BNX3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNX3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNX3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNX3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNX3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNX3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNX3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNX3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNX3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNX3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNX3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNX3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNX3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNX3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNX3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNX3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNX3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BNX3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BNX3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BNX3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BNX3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BNX3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BNX3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BNX3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BNX3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BNX3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BNX3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BNX3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BNX3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BNX3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BNX3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BNX3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BNX3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BNX3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BNX3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNX3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNX3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNX3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNX3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNX3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNX3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNX3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNX3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNX3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BNX3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BNX3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BNX3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BNX3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BNX3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BNX3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BNX3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BNX3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BNX3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BNX3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BNX3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BNX3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BNX3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BNX3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BNX3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BNX3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BNX3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BNX3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BNX3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BNX3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BNX3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BNX3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BNX3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BNX3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BNX3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BNX3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BNX3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BNX3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms