Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMTNL1A8MU46 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMTNL1A8MU46 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMTNL1A8MU46 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMTNL1A8MU46 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMTNL1A8MU46 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMTNL1A8MU46 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMTNL1A8MU46 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMTNL1A8MU46 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMTNL1A8MU46 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMTNL1A8MU46 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SMTNL1A8MU46 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMTNL1A8MU46 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMTNL1A8MU46 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMTNL1A8MU46 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMTNL1A8MU46 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SMTNL1A8MU46 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMTNL1A8MU46 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SMTNL1A8MU46 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms