Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C4orf47A7E2U8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C4orf47A7E2U8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4orf47A7E2U8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms