Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
ARID3CA6NKF2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
ARID3CA6NKF2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
ARID3CA6NKF2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
ARID3CA6NKF2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
ARID3CA6NKF2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
ARID3CA6NKF2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
ARID3CA6NKF2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ARID3CA6NKF2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ARID3CA6NKF2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
ARID3CA6NKF2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
ARID3CA6NKF2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
ARID3CA6NKF2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
ARID3CA6NKF2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ARID3CA6NKF2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ARID3CA6NKF2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
ARID3CA6NKF2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
ARID3CA6NKF2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
ARID3CA6NKF2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
ARID3CA6NKF2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ARID3CA6NKF2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ARID3CA6NKF2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
ARID3CA6NKF2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
ARID3CA6NKF2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms