Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCNX2A6NKB5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCNX2A6NKB5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNX2A6NKB5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNX2A6NKB5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms