Protein–RNA interactions for Protein: A6NGC4

TLCD2, TLC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD2A6NGC4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TLCD2A6NGC4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TLCD2A6NGC4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLCD2A6NGC4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms