Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA6L4A6NEF3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6L4A6NEF3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
GOLGA6L4A6NEF3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA6L4A6NEF3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA6L4A6NEF3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms