Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM43BA6NCK2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM43BA6NCK2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM43BA6NCK2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM43BA6NCK2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM43BA6NCK2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM43BA6NCK2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM43BA6NCK2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43BA6NCK2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43BA6NCK2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43BA6NCK2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43BA6NCK2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43BA6NCK2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43BA6NCK2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43BA6NCK2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM43BA6NCK2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms