Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.9 ms