Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRD1A4D1F6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRD1A4D1F6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRD1A4D1F6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRD1A4D1F6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms