Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms