Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNX5Q9Y5X3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX5Q9Y5X3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX5Q9Y5X3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms