Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SRPRBQ9Y5M8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRPRBQ9Y5M8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRPRBQ9Y5M8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRPRBQ9Y5M8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms