Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHLA3Q9XRX5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHLA3Q9XRX5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HHLA3Q9XRX5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HHLA3Q9XRX5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHLA3Q9XRX5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHLA3Q9XRX5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHLA3Q9XRX5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHLA3Q9XRX5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HHLA3Q9XRX5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHLA3Q9XRX5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms