Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB23Q9ULC3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB23Q9ULC3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB23Q9ULC3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms