Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSL6Q9UKU0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSL6Q9UKU0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL6Q9UKU0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL6Q9UKU0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL6Q9UKU0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL6Q9UKU0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL6Q9UKU0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL6Q9UKU0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL6Q9UKU0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL6Q9UKU0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL6Q9UKU0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL6Q9UKU0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL6Q9UKU0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL6Q9UKU0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL6Q9UKU0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL6Q9UKU0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms