Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJD2Q9UKL4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD2Q9UKL4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD2Q9UKL4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD2Q9UKL4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD2Q9UKL4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD2Q9UKL4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD2Q9UKL4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJD2Q9UKL4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJD2Q9UKL4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJD2Q9UKL4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GJD2Q9UKL4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD2Q9UKL4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms