Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD3Q9UJU5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXD3Q9UJU5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms