Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIQ6

LNPEP, Leucyl-cystinyl aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPEPQ9UIQ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPEPQ9UIQ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LNPEPQ9UIQ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LNPEPQ9UIQ6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LNPEPQ9UIQ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LNPEPQ9UIQ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LNPEPQ9UIQ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LNPEPQ9UIQ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LNPEPQ9UIQ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LNPEPQ9UIQ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LNPEPQ9UIQ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LNPEPQ9UIQ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LNPEPQ9UIQ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
LNPEPQ9UIQ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms