Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ6

SHPK, Sedoheptulokinase, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPKQ9UHJ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHPKQ9UHJ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPKQ9UHJ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPKQ9UHJ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms