Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEPT3Q9UH03 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SEPT3Q9UH03 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEPT3Q9UH03 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEPT3Q9UH03 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEPT3Q9UH03 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEPT3Q9UH03 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEPT3Q9UH03 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEPT3Q9UH03 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEPT3Q9UH03 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEPT3Q9UH03 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEPT3Q9UH03 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEPT3Q9UH03 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEPT3Q9UH03 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms