Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUX4Q9UBX2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUX4Q9UBX2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4Q9UBX2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.8 ms