Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3KQ9UBQ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3KQ9UBQ5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms