Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF10DQ9UBN6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms