Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAJC17Q9NVM6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNAJC17Q9NVM6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms