Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXD2Q9NVH0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXD2Q9NVH0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXD2Q9NVH0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXD2Q9NVH0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1301.4 ms