Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD1Q9NS62 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THSD1Q9NS62 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
THSD1Q9NS62 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms