Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL1Q9NR64 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL1Q9NR64 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms