Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCX3AQ9NNX9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCX3AQ9NNX9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCX3AQ9NNX9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCX3AQ9NNX9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms