Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC2Q9HCC0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms