Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPCSQ9HAB8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPCSQ9HAB8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPCSQ9HAB8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms