Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIPK3Q9H422 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIPK3Q9H422 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIPK3Q9H422 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIPK3Q9H422 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIPK3Q9H422 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIPK3Q9H422 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIPK3Q9H422 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIPK3Q9H422 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIPK3Q9H422 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HIPK3Q9H422 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIPK3Q9H422 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIPK3Q9H422 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIPK3Q9H422 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIPK3Q9H422 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HIPK3Q9H422 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms