Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
REXO4Q9GZR2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
REXO4Q9GZR2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REXO4Q9GZR2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms