Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDEL1Q9GZM8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDEL1Q9GZM8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms