Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PARD6BQ9BYG5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PARD6BQ9BYG5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARD6BQ9BYG5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARD6BQ9BYG5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms