Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNHG12Q9BXW3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNHG12Q9BXW3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms