Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC106Q9BWC9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC106Q9BWC9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms