Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM246Q9BRR3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms